PCR(Polymerase chain reaction)又称聚合酶链式反应,是模拟DNA的复制过程,在体外特异性扩增DNA片段的方法,从而获得大量的同一序列DNA。1971年,Khorana等提出在体外经DNA变性,与适当引物杂交,再用DNA聚合酶延伸,克隆DNA的设想。1983年,Cetus 公司的 K.Mullis发明了PCR技术,使Khorana的设想得到实现。1988年,Saiki等将耐热DNA聚合酶(Taq)引入了PCR技术 。1989年美国《Science》杂志列PCR 为十余项重大科学发明之首,比喻1989年为PCR爆炸年,Mullis荣获1993年度诺贝尔化学奖。
一.PCR技术的基本原理
1. PCR又称无细胞分子克隆法:在微量离心管中,加入适量的缓冲液,微量的模板DNA,四种脱氧单核苷酸,耐热性多聚酶,一对合成DNA的引物,通过高温变性、低温退火和中温延伸三个阶段为一个循环,每一次循环使特异区段的基因拷贝数放大一倍,一般样品是经过30次循环,理论上扩增产物量成指数上升,既n个循环后,产量为2n拷贝。
30次循环后靶序列扩增的数量
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2.PCR的基本步骤
(1)PCR反应体系的建立
取0.2ml的薄壁离心管,将模板DNA、ddH2O、dNTPs (2.5mM each)、反应缓冲液、Taq DNA聚合酶、上下游引物按顺序加入试剂,稍混匀,短暂离心,把溶液甩至管底。
(2)PCR的变温程序(热循环反应)
将上述试剂放入PCR仪中,按PCR反应的变温程序进行扩增。反应结束后低温保存或检测
(3) PCR扩增产物的电泳检测
三. PCR技术在动物疾病诊断中的应用
1. 诊断RNA病毒病
兽医临床上,严重危害鸡群及猪群健康的重大疾病多为RNA病毒,如禽流感(AI)、新城疫(ND)、传染性支气管炎(IB)、禽偏肺病毒(APV),猪蓝耳病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、伪狂犬病毒(PRV)等。应用PCR技术对这些疾病进行诊断,具有重大意义。检测RNA的PCR技术称为RT-PCR技术,该反应可分为两个步骤:第一步,在单引物的介导和反转录酶的催化下,合成RNA 的互补链cDNA;第二步,加热后cDNA 与RNA 链解离,然后与另一引物退火,并由DNA 聚合酶催化引物延伸生成双链靶DNA,最后像一般的PCR 一样,扩增靶DNA。
例如,在禽流感的诊断中,用RT-PCR方法将决定病毒毒力的HA切割位点进行测序,将其用于实验感染病毒株或弱毒株的检测,RT- PCR均能检测出HA基因,甚至在其他标准试验检测为阴性的样品中也能检测出。将RT-PCR结合HA酶切位点的序列测定,对于评估AI病毒毒力提供了一种快速敏感的方法。陈化兰等首次建立了稳定可靠的RT-PCR方法扩增HA全基因,为其他亚型和毒株的基因体外扩增提供了手段。
2. 诊断DNA病毒病
鸡最常见的DNA病毒病为马立克(MD),禽白血病(ALV)、网状内皮增生症(REV);猪最常见的DNA病毒为圆环病毒;牛最常见的DNA病毒为牛结核病毒。例如,在MDV-1基因组的Bam HI和Bam HD片段内有一保守的132 bp重复序列,强毒株一般有2~3个重复,而弱毒株则有3个以上的重复拷贝数,通过产物的重复序列可以进行区分。Becker等用PCR将致病和非致病的马立克病毒血清I型、疫苗株Ⅱ型进行比较,结果表明,PCR可以对样品中的马立克病毒血清I型和疫苗株进行早期鉴别。韦平等根据基因组特征,以PCR为基础,建立一种能快速鉴别MD、ALV和REV这3种常见鸡病毒性肿瘤病的三重PCR,该方法可对3种病原进行一次PCR 扩增,在此基础上又研制了鸡病毒性肿瘤快速鉴别诊断试剂盒。
3. 诊断其它病原体性疾病
PCR技术在检测其它病原体性疾病方面也有广阔的前景。高以明等根据已发表的禽鸡毒支原体(MG)和滑膜囊支原体(MS)的基因文库,利用oligo5.0设计共同针对MG、MS模板的一对引物,通过PCR扩增,电泳分析,MG检出率为l0.25% ,分离培养的阳性符合率为100%。
四.PCR技术应用前景
PCR技术在动物疫病研究和诊断方面,已成为非常实用的工具,PCR技术无疑将广泛地应用于兽医学领域,包括诊断病原、基因表达、遗传病检测、肿瘤细胞监测等方面。以PCR为基础的一系列实验已成为常规检验手段,运用多重PCR技术快速诊断不同病原的方法正不断建立,PCR尤其适用于许多持续性病毒感染的慢性疾病,对于不能产生炎症反应的新病毒和检测丢失某些基因的病毒,是目前PCR研究领域的新课题。随着研究的深入,PCR技术将更趋于自动化、标准化、简洁化,拥有更为广阔的前景。( 山东益生畜禽疾病研究院 李玉燕 )
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